I calamari della Patagonia sono molto sottili, basta una scottata per cuocerli.
Io sinceramente non li pastorizzerei in sottovuoto, ma se proprio non riesci a evitare questo passaggio ti consiglio una temperatura molto alta per pochissimo tempo, tipo 92 °C per 2 minuti.
Invece per i calamari ripieni, immagino che le patate e le cime di rapa siano già cotti. Quindi in questo caso opterei per una temperatura prossima ai 65 °C per avere la stessa temperatura al cuore, in modo da raggiungere una pastorizzazione completa.
Potresti provare 67 °C per 40 minuti se lo spessore non è più di 3-4 cm.